Cuprins
- Introducere 1
- 2. Cancerul. Fundamente genetice si moleculare 4
- 2.1. No.iuni generale despre ciclul celular 4
- 2.1.1. Materialul genetic 5
- 2.1.2. Marea diviziune. Diviziunea celularã 7
- 2.2. Dezvoltarea cancerului ca un proces microevolutiv. Biologia cancerului 9
- 2.3. Tipuri de muta.ii în cancer 11
- 2.4. Procesele ce stau la baza mentinerii corecte a secventei de ADN 14
- 2.5. Principalele caracteristici ale celulelor canceroase 16
- 2.6. Semnificatia apoptozei în terapia cancerului 18
- 2.7. Controlul proliferãrii celulare în întelegerea cancerului 20
- 2.8. Metastazele 20
- 2.9. Cauzele de aparitie si prevenirea cancerului 22
- 2.9.1. Virusurile si alte infectii ce contribuie la formarea cancerului 24
- 2.9.2. Unele moduri de evitare a cancerului 24
- 2.10. Abordarea pacientului cu cancer. Studiu de caz: cancerul ovarian 26
- 2.10.1. Cancerul ovarian. Generalitãti 26
- 2.10.2. Principiile terapiei cancerului 27
- 2.10.3. Diagnosticare 28
- 2.10.4. Tratament. Principiile terapiei chirurgicale, radioterapiei si chimioterapiei 29
- 2.10.5. Tipuri de tumori 31
- 3. Abordãri în modelarea cancerului 33
- 3.1. Introducere în modelare. Modele dinamice continue 33
- 3.2. Modelul Exponential (Malthusian) continuu de crestere tumoralã 36
- 3.3. Modelul Logistic continuu de crestere tumoralã 38
- 3.4. Competitia celulelor sistemului imunitar cu celulele maligne. Un model al
- rãspunsului imunitar în lupta cu tumorile. 40
- 3.4.1. Sistemul imunitar. Generalitãti. 40
- 3.4.2. Un exemplu de model al rãspunsului imunitar în lupta cu tumorile 41
- 4. Procesele de reglare de la nivelul genelor implicate în cancer 45
- 4.1. Baza molecularã a comportamentului celulelor canceroase. Identificarea genelor
- critice, specifice cancerului 45
- 4.1.1. Genele critice 46
- 4.1.2. Oncogenele. Identificare 47
- 4.1.3. Exemple de gene critice hiperactive sau cu caracter stimulator 47
- 4.1.4. Genele supresoare. Identificare prin studierea cazurilor de cancere ereditare 48
- 4.1.5. Identificarea genelor supresoare prin alte metode 49
- 4.1.6. Exemple de gene critice hipoactive 50
- 4.1.7. Cooperarea dintre oncogene si gene supresoare in carcinogenezã 50
- 4.2. Principiile comportamentului celular. Cãi de semnalizare celularã 51
- 4.2.1. Semnalizarea celularã 52
- 4.3. Conditii ce stau la baza promovãrii cancerului 55
- 4.3.1. Reglarea mortii celulare. Mutatii în genele ce regleazã apoptoza 56
- 4.3.2. Mutatiile din gena P53 permit supravietuirea si proliferarea celulelor
- canceroase, în ciuda alterãrii ADN-ului 57
- 4.3.3. Virusurile activeazã replicarea celularã 58
- 4.3.4. Scurtarea telomerilor promoveazã dezvoltarea cancerului 59
- 4.4. Mutatiile ce conduc spre metastazã reprezintã în continuare un mister 60
- 4.5. Legãtura dintre tumori si diferite mutatii ale genelor specifice 62
- 5. Contributii proprii 63
- 5.1. O scurtã introducere 63
- 5.2. Rolul genei Rb în semnalizarea celularã 66
- 5.2.1. Calea Rb-E2f si proliferarea celularã 67
- 5.2.2. Interactiunea genelor critice în semnalizarea celularã 68
- 5.3. Motivatia alegerii si explicarea modelului propus 69
- 5.4. Descrierea aplicatiei. Modelul si relatiile matematice 70
- 5.5. Rezultatele obtinute în simulãri 74
- 5.6. Comparatii si concluzii 83
- 6. Concluzii 87
- 7. Anexã 91
- 8. Bibliografie 94
Extras din proiect
CAPITOLUL 1
INTRODUCERE
Biologia este una dintre stiintele puternic interdisciplinare, care studiazã manifestãrile
si aspectele organismelor vii.
Bioinformatica este stiinta aflatã la intersectia dintre biologie si stiinta calculatoarelor.
Pentru bioinformaticã s-au dat diverse definitii, precum: stiinta care se ocupa cu aplicarea
tehnicilor de calcul, în vederea organizãrii si analizei datelor biologice; sau disciplina care se
referã la analiza si interpretarea datelor biologice; sau ansamblul proceselor prin care datele
biologice pot fi prelucrate pentru a obtine informatii si cunostiinte, dar toate aceste definitii se
rezumã unui scop final, acela de întelegere cât mai profundã a mecanismelor vietii, la diferite
nivele.
Sistemele biologice celulare sunt caracterizate prin schimburi continue de semnale cu
mediul înconjurãtor, aceastã particularitate a lor fiind esen.ialã pentru existenta si
functionarea propice a organismelor.
Alterãrile în sistemul complex de comunicatie celularã, pot avea urmãri grave asupra
stabilitãtii celulare si pot promova boli periculoase asupra sãnãtãtii organismelor. Printre
aceste boli se enumerã si cancerul, o modificare a echilibrului celular, caracterizatã printr-un
numãr ridicat de celule alterate, celule care se divid în ciuda semnalelor de alarmã date de
corp si formeazã tumori, care pot sã invadeze întregul organismul, rezultând metastaze, adicã
grupãri de celule modificate, toxice pentru viata oricãrui individ.
Toate sistemele biologice reale, sunt sisteme dinamice, adicã la fiecare moment de
timp ele suferã diferite modificãri. stiinte precum matematica sau informatica, combinate cu
stiintele biologice, au scos în evidentã noi trãsãturi ale acestora din urmã. Cu ajutorul
modelelelor matematice, s-a ajuns la o întelegere mai amplã a functionalitãtii proceselor reale,
iar prin interpretarea datelor disponibile, s-au putut genera preziceri asupra evolutiei
sistemelor. De asemenea, s-au putut obtine informatii despre anumiti parametrii care nu
puteau fi mãsurati în sistemele reale; s-au putut confirma, infirma sau sugera diferite ipoteze
cu privire la functionalitatea proceselor, toate acestea detinând un rol deosebit în cercetãrile
stiintifice moderne.
Lucrarea de fatã abordeazã problema diagnosticãrii si formãrii celulelor canceroase la
nivel molecular si modul în care ele deterioreazã întreg organismul. Cancerul este si va fi în
continuare o problemã mondialã, privind alterarea sãnãtãtii indivizilor si desi în prezent, s-a
ajuns la un grad de cunoastere ridicat fatã de aceastã problemã, specialistii nu au reusit încã sã
gãseascã rãspuns la toate procesele care au loc, înainte ca o celulã sã sufere mutatii într-atât de
2
multe si diferite, încât sã dea nastere unor clone ce promoveazã formarea tesuturilor
neoplazice.
Cancerul va ridica încã multi ani de-acum încolo, întrebãri legate de formarea si
expansiunea lui, tehnologia, desi foarte avansatã, nereusind nici pânã acum, sã ofere
rãspunsuri satisfãcãtoare sau tratamente sigure în vederea eradicãrii oricãrui tip de cancer.
Motivatia alegerii acestei teme este deci implicatia majorã pe care cancerul o are în
cadrul sistemului public de sãnãtate si modul în care acesta actioneazã de la un nivel micro, de
mutatie a unei celule, pânã la un nivel macro, de formare a metastazelor, în diferite zone din
corp, reusind sã treacã cu succes de barierele pe care corpul le ridicã, în vederea mentinerii
stabilitãtii celulare.
Obiectivele generale ale lucrãrii sunt:
. întelegerea modului de evolutie a cancerului, prin aparitia de mutatii succesive în celulele
corpului;
. determinarea caracteristicilor ce fac o celulã sã devinã canceroasa;
. explicarea cauzelor de aparitie a cancerului si determinarea metodelor de prevenire a
acestuia;
. definirea principalelor cãi de semnalizare, care alterate servesc la activarea mutatiilor si la
dezactivarea mecanismelor de apãrare celularã;
. stabilirea rolurilor genelor critice specifice cancerului în cãile de comunicare celularã;
. determinarea unui model matematic care sã simuleze un proces real, ce are loc în
momentul initierii cancerului, în vederea diagnosticãrii si cercetãrii ulterioare;
. generarea unor seturi evidente de grafice, care atestã sau nu existenta bolii în corp;
Scopul final fiind fixarea unor notiuni de bazã privind formarea si supravietuirea celulelor
maligne în organismul uman.
Astfel, în Capitolul 2. Cancerul. Fundamente genetice si moleculare, vor fi
prezentate conceptele biologice de bazã, necesare pentru întelegerea structurii i func.ionãrii
celulelor normale, transformarea lor în celule maligne si formarea fenomenului canceros si a
tumorilor. Ulterior, se vor discuta cauzele de aparitie ale tumorilor si informatii despre
prevenire, capitolul finalizându-se printr-o prezentare a unui studiu de caz, referitor la
cancerul de ovar. Detalii despre subiectele enumerate mai sus se pot gãsi în cãr.i de
specialitate, cum ar fi (Alberts B. et al., 2002), (Harrison, 2003), (Lodish H. et al., 2000), atât
pentru biologia molecularã i celularã, cât si pentru biologia celulelor canceroase i studii
despre diverse tipuri de cancer.
Preview document
Conținut arhivă zip
- Modelarea Proceselor de Reglare de la Nivelul Genelor Implicate in Cancer.pdf