Metode molecular-genetice pentru identificarea patogenului Candidă

1. Introducere

Candida este un microorganism comun care se regăseşte la om cât și la unele animale . Genomul standard C. albicans este un diploid compus din opt perechi de cromozomi omologi, variind în mărime de la aproximativ 33 până la 095 Mb [1]. Candida albicans are un mod clonă predominant de reproducere. A fost prima ciupercă importantă patogenă medicală pentru care secvența completă a genomului a fost determinată [ 2]. Primul genom eşalonat a fost clinic izolat SC5314, care a prezentat un grad ridicat de heterozygosity, incluzând mai mult de 55 700 de polimorfisme unicleotidice (SNP) în genomul diploid 32 Mb [2]. In ciuda diploidiei sale și reproducerii clonale, C. albicans este capabilă să atingă o rată ridicată de o diversitate genetică în mai multe moduri, incluzand recombinare, polimorfismelor cromozomiale, de înlocuire a genelor şi de împerechere criptic, reflectând plasticitatea genomului [1], [3].

De-a lungul ultimelor trei decenii, C. albicans a devenit un important agent patogen medical, responsabil pentru infecţiile superficiale precum și infecţiile profunde. Sindroamele determinate de infecţia cu Candida sunt dependente în principal de statusul imun al gazdei. Încă de la începutul anilor 1980, candidoză invazivă, cauzată în principal de specii de Candida, a devenit o problemă proeminentă [4], din cauza numărului tot mai mare de pacienți imunocompromiși și pacientii din sectiile de terapie intensiva au risc crescut de infecţie cu Candida. . Acest lucru subliniază necesitatea de punere în aplicare a măsurilor de control adecvate, care necesită în mod evident, o cunoaștere ridicată a biologiei și epidemiologia speciilor de Candida, inclusiv C. albicans, care sunt recunoscute ca fiind deosebit de complexe.

Într-adevăr, același individ sănătos poate găzdui aceeași tulpină în diferite locații ale corpului, sau poate transporta tulpini nerelatate în acelaşi loc sau în diferite părţi ale corpului [5], tulpinile se pot înlocui reciproc în infecții recurente [6], fiind supuse microevoluției (modificări minore în genotip cu un număr relativ mic de generații de celule [7] și subtulpinile mixte (schimbări în subpopulațiile din cadrul persoanelor fizice în timp) să fie transferate de la un individ la altul [8], [9], [10], tulpinile specifice pot predomina în anumite zone geografice și unele tulpini pot fi endemice în unele spitale şi pot suferi o microevoluție în spital. Candida poate invada orice structură anatomică.

Mortalitatea mare în infeţtiile sistemice este cauzată de lipsa unor metode sensibile şi specifice de diagnostic care să permită identificarea speciilor de Candida la nivelul ţesuturilor.

Specii de Candida

Există mai mult de 200 specii de Candida. Doar o mică parte dintre aceştia determină patologie umană:

- Candida albicans - este specia cea mai frecventă întâlnită (50 - 60%)

- Candida glabrata (15 - 20%)

- Candida parapsilosis (10 - 20%)

- Candida tropicalis (6 - 12%)

- Candida krusei (1 - 3 %)

- Candida kefyr (mai puţin de 5 %)

- Candida lusitanie (mai puţin de 5 %)

- Candida guilliermondi (mai puţin de 5 %)

- Candida dubliniensis [11].

Candidoza bucală este determinată cel mai frecvent de Candida albicans, dar pot fi implicate şi alte genuri precum Candida tropicalis, Candida krusei, Candida parapsilosis sau Candida glabrata. Inmulţirea acestei ciuperci este controlată de o serie de bacterii prezente la nivelul mucoasei bucale. Apariţia unei noi bacterii la nivelul gurii ce rupe echilibrul dintre microorganismele deja prezente aici, va permite ciupercii să se înmulţească în mod necontrolat. Candidoza bucală este mai frecventă la nou-născuţi, sugari şi batrâni.

Unele medicamente permit ciupercilor să se înmulţeasca necontrolat:

- antibioticele, în special cele cu spectru larg (de exemplu, tetraciclina);

- contraceptive orale (pilulele);

- medicamente ce scad capacitatea de apărare a organismului precum corticosteroizii.

Modul de transmitere a ciupercii ce determina candidoza bucală diferă în funcţie de vârstă [12].