Pectin Liaze

Clasificare si nomenclatura:

Enzimele se clasifica in functie de tipul de reactie pe care il catalizeaza in 6 mari clase astfel:

1. oxidoreductaze

2. transferaze

3. hidrolaze

4. liaze

5. izomeraze

6. ligaze sau sintetaze

Enzimele reunite intr-o anumita clasa sunt ulterior clasificate in subclase si subsubclase in functie de unele detalii privind gruparile chimice asupra carora actioneaza, cofactorii implicatii in reactie respective etc. De asemenea, fiecare enzima este caracterizata printr-un cod format din patru cifre, care contine informatii despre enzima. Prima cifra din cod reprezinta apartenenta la una din cele sase mari clase de enzime

Pectinliazele fac parte din clasa liazelor avand codul 4.2.2.10.

Alte nume : pectin - trans eliminaza, endo-pectin liaza, polimetilgalacturonic transeliminaza, pectin metiltranseliminaza, pectoliaza, PL;PNL;PMGL.

Nume sistematic : (1→4)-6-O-metil-α-D-galacturonan liaza.

Reactia catalizata :

Clivarea eliminatorie a esterului metal-(1-4)--galacturonic pentru formarea de oligozaharide cu grupe 4-deoxi-6-O-metil-alfa-D-galacto-4-enuronozilice la capetele lor nereducatoare.

Structura:

Structura primara a unui segment dintr-o catena polipetidica sau a unei proteine este reprezentata de secventa aminoacizilor si nu inglobeaza arnjamente spatiale ( cu exceptia configuratiei α- atomului de carbon). Aceasta definitie nu include pozitiile legaturilor disulfurice si deci nu este identica cu “structura covalenta”.

Structura secundara a unui segment dintr-o catena polipeptidica reprezinta aranjamentul spatial local al principalilor atomi care constituie scheletul catenei, fara a tine seama de conformatia resturilor R si de relatiile cu alte segmente.

Structura tertiara a unei molecule de proteina sau a unei subunitati dintr-o molecula de proteina este reprezentata de aranjamentul tuturor atomilor in spatiu, fara a considera relatiile cu molecule vecine sau subunitati.

Structura cuaternara a enzimelor reprezinta cel mai inalt nivel de organizare a macromoleculelor proteice. Proteinele cu mase moleculare mari si foarte mari sunt constituite din mai multe catene polipetidice.

Substrat:

Pectin liazele manifestă specificitate pentru substrate înalt esterificate, acţiunea lor aleatoare conducând la formarea de oligo-D-galacturonaţi nesaturaţi. Majoritatea pectin liazelor purificate şi caracterizate sunt de origine fungică.

Activitatea acestui tip de liaze este afectată de distribuţia grupărilor esterificate în catena poli-D-galacturonanică. Studiile realizate pe substrate cu diferite grade de esterificare şi cu o distribuţie diferită a grupărilor esterificate, au arătat o activitate mai mare asupra substratelor deesterificate enzimatic comparativ cu cea manifestată pe substrate deesterificate în mediu alcalin. Pectinele deesterificate enzimatic au o distribuţie regulată a grupărilor esterice, în timp ce deesterificarea chimică conduce la o distribuţie statistică a acestor grupări.

Pectinele înalt esterificate sunt cele mai bune substrate pentru pectin liaze. Pectaţii, amidele acidului pectic şi glicilesterii pectinei nu sunt degradaţi de pectin liaze.

Modul de acţiune al pectin liazelor a fost pus în evidenţă prin analiza produşilor rezultaţi în urma scindării tetra-, penta- şi hexa-galacturonaţilor